Институт был основан в 1986 г. бывший факультет акупунктуры и массажа Чжэцзянского института традиционной китайской медицины. В 2003 г. институт и амбулаторное отделение Чжэцзянского института традиционной китайской медицины осуществили план по "объединение отделения и факультета" и в 2006 г. были переименованы в Третий институт клинической медицины, а в 2017 г. в состав Третьего института клинической медицины вошел Институт реабилитационной медицины. В университете предлагается три специальности бакалавриата: акупунктура и массаж, реабилитационная терапия и реабилитация китайской медицины, а также программа "5+3" для группы лучших талантов по акупунктуре и массажу, из которых специальность акупунктуры и массажа — это площадка для строительства первоклассных программ бакалавриата на государственном уровне, первая категория характерных специальностей Министерства образования, ключевая строительная специальность университетов на уровне провинции Чжэцзян, преимущественная специальность провинции Чжэцзян «Тринадцатой пятилетки», зарождающаяся характерная специальность и специальность с характеристикой интернационализации, а восстановительная терапия и реабилитация китайской медицины — площадки для строительства первоклассных программ бакалавриата на провинциальном уровне. При университете 2 исследовательских центра постдокторантуры по первоклассным специальностям, 6 пунктов присуждения степени доктора, 17 пунктов присуждения степени магистра и 14 баз подготовки магистров под параллельным управлением, включая Больницу традиционной китайской медицины города Нинбо, Больницу традиционной китайской медицины города Шаосина, Больницу традиционной китайской медицины города Вэньчжоу и др. Специальность клинической медицины вошла в 1% мирового рейтинга дисциплин ESI.

Количество штатных преподавателей в университете составляет более 70 человек, в том числе 20 профессоров и 34 доцента. В институте работают 38 докторов и 30 магистров. Имеется 17 научных руководителей докторантов и 141 научный руководитель магистров; 2 эксперта со специальным пособием Госсовета, 1 национальный мастер-преподаватель высшего образования по традиционной китайской медицине, 3 провинциальных мастера-преподавателя и 1 провинциальный отличный преподаватель. 1 национальный выдающийся деятель науки и техники, 1 Я не понимаю, что такое «Ученые Цихуана» по проекту наследования и инноваций китайской медицины "Миллион и десять миллионов талантов", 1 молодой исключительно талантливый специалист в рамках национального плана "Десять тысяч человек", 8 национальных научных руководителей по преемственности академического опыта специалистов китайской медицины, 4 известных преподавателя китайской медицины провинция Чжэцзян, 11 известных врачей китайской медицины провинции Чжэцзян,1 специалист среднего и молодого возраста с выдающимся вкладом в ТКМ, 2 провинциальных таланта здравоохранения, 2 молодых исключительно талантливых специалиста в рамках провинциального плана "Десять тысяч человек", 1 специалист с финансированием проектов типа D провинциальной  программы ««Цяньцзянских стипендиатов», 1 специально приглашённый профессор программы "Ученый Цяньцзян" провинции Чжэцзян. При провинциальном проекте "151 талант нового века", 1 преподаватель получил ключевое финансирование обучения, 1 преподаватель является специалистом подготовки первого уровня, 1 преподаватель — второго уровня, 6 преподавателей — третьего уровня. 1 получатель провинциального проекта Фонда выдающихся молодых ученых. 7 преподавателей являются специалистами подготовки инновационных кадров в области здравоохранения, и 11 преподавателей являются специалистами подготовки молодых талантов в круге врачей провинции Чжэцзян. Также в университетский штат входят 6 национальных талантов клинической китайской медицины, 15 специалистов клинической китайской медицины среднего и молодого возраста на провинциальном уровне; 3 преподавателя являются специалистами подготовки лидеров научного исследования среднего и молодого возраста среди провинциальных университетов, 4 преподавателя — специалисты подготовки лидеров-талантов среди провинциальных университетов, 2 специалиста – национальные главные таланты сестринского дела традиционной китайской медицины, 1 провинциальный талант в области сестринского дела традиционной китайской медицины.

Чжэцзянский университет традиционной медицины  и Третья больница при университете реализует принцип "объединения университета и больницы", больница представляет собой больницу третьей (наивысшей) степени китайской медицины при Государственном управлении традиционной китайской медицины, комплексную больницу китайской медицины третьей степени провинции Чжэцзян. Больница входит в первую партию стандартизированных баз обучения китайской медицины резидентов, с 3 национальными клиническими ключевыми специальностями: акупунктура, массаж, реабилитация. Всего в больнице 3 ключевые дисциплины Государственного управления традиционной китайской медицины, 1 провинциальная "приоритетная" дисциплина, 5 провинциальных ключевых дисциплин традиционной китайской медицины;1 провинциальная ключевая лаборатория, 1 национальная научно-исследовательская лаборатория традиционной китайской медицины 3-го уровня; 1 провинциальная университетская инновационная группа, 1 провинциальная научно-техническая инновационная группа. Имеется 1 качественный курс обучения государственного уровня, 1 качественный курс государственного уровня по разделению ресурсов, 1 национальный открытый видео-курс, 1 национальный открытый онлайн-курс, 1 национальный МООС-курс Альянса китайской медицины, 4 провинциальных качественных курса, 2 провинциальных качественных открытых онлайн-курса. Разработанная институтом модель воспитания специалистов "двойное нужно заменить это слово и двойная интеграция" была удостоена второй премии за достижения в области преподавания в провинции Чжэцзян. Кроме того, были утверждены 2 провинциальные команды преподавателей, присуждены 2 вторые премии за достижения в области преподавания, 2 премии за достижения в области образовательных технологий и 1 третья премия, а также ряд премий, таких как специальная премия за отличные примеры в конкурсе "Интернет + преподавание" провинции Чжэцзян. Институт уделяет большое внимание инновациям в области науки и образования. За последние десять лет было основано более 300 проектов на уровне департаментов и бюро и также на более высоком уровне, получено более 35 млн. юаней финансирования на реализацию проектов, получено более 40 наград за научные и технологические достижения различных типов, получено 20 национальных патентов на изобретения и 78 практических патентов нового типа.

Университе следует закону медицинского образования и роста высококвалифицированных работников, ориентируясь на "сочетание высокой нравственности и таланта, всестороннее развитие"; реализует фундаментальную задачу воспитания высокоморальных людей; создает модель подготовки специалистов "триединство" при которой сочетаются знания, навыки и нравственность; стремится к воспитанию специалистов с твердыми идеалами и убеждениями, прочной профессиональной основой, отличными практическими навыками; готовит специалистов акупунктуры и массажа, реабилитационной терапии, которые адаптируются к потребностям экономического и социального развития и потребностям развития медицины и индустрии здравоохранения. В последние годы общий уровень трудоустройства выпускников университетаподдерживается на высоком уровне. Университет предоставляет обществу множество высококачественных медицинских талантов, получивших высокую степень удовлетворенности со стороны работодателей.